1．1遗传因素；遗传是本症的易患因素。单卵双生儿孤独症的一致性>90％，双卵一致性为24％。本症患儿的同胞患孤独症较正常人高3—4倍，提示本症与遗传因素相关，但具体的遗传方式尚不明了

1．2脑器质性因素；本症患儿有围生期损害史、脑电图异常、神经系统软体征以及癫痫发作较多见，少数病例CT头颅扫描提示脑室扩大；磁共振成像检查见部分患脑蚓部发育不全，故认为本症与中枢神经系统异常所致功能障碍有关旧-。

1．3神经生化因素；发育过程的关键期和可塑性是神经生物学研究的重要内容。儿童行为与神经递质密切相关，认为与中枢神经系统5-羟色胺和(或)多巴胺活性下降相关。伴有下丘脑功能障碍则可产生孤独症。

1．4认知缺陷因素；有学者提出了认知功能与社会功能相关的学说，认为心理认知缺陷损害了孤独症患儿对他人精神状态的理解能力，导致社会交往能力的缺乏，甚至对待人就像对待无生命的物体，常错误理解别人有意识的行为旧。

1．5多种病因；孤独症常与某些疾病同时存在，如脆性x综合征、结节性硬化、肌营养不良、先天性风疹、苯丙酮尿症以及嘌呤代谢病等。因此可以认为孤独症是一个多种病因的神经综合征。由此可见，许多学者从不同的角度探讨孤独症的原因，包括生物学基础研究，但导致孤独症病因的性质，目前还不大清楚，有待进一步研究阐明。